L'Asie centrale est proposée comme lieu de naissance des chiens

Le 19 octobre 2015, la prestigieuse instance de l'Académie nationale des sciences, connue sous le nom de PNAS , a publié la dernière édition du concours d'origines du chien, «La structure génétique des chiens de village révèle l'origine de la domestication en Asie centrale». [Un abonnement est nécessaire pour voir l'article.] Les entrées précédentes pour où les chiens ont commencé à se séparer des loups ont inclus le Moyen-Orient, en particulier la zone englobée par le Levant; la Steppe Mammouth à travers l'Eurasie. et Asie de l'Est au sud du Yangtze.

Un chien de village mongol.

Source: Doug Lally, utilisé avec permission.

Cette fois-ci, les chercheurs impliqués dans un projet pluriannuel d'obtention d'échantillons d'ADN de la population canine du monde – des chiens reproducteurs vivant en grande partie dans le monde en développement – ont annoncé que l'enquête génétique la plus complète à ce jour portait sur l'Asie centrale. environ de la Mongolie au Népal-comme la région d'origine probable pour les chiens.

En écrivant pour le groupe, Laura M. Shannon a déclaré que leurs conclusions étaient basées sur l'analyse des données génomiques de 549 chiens de village de 38 nations et de 4676 chiens de race représentant 161 races. Les enquêtes antérieures sur l'ascendance avaient tendance à se concentrer sur l'ADN mitochondrial – le matériel génétique impliqué dans le système énergétique de la cellule et hérité de la mère – parce qu'il était relativement facile de séquencer et d'analyser les patrons de l'héritage maternel. D'autres ont regardé le chromosome Y pour étudier l'héritage paternel. Souvent, les deux méthodes ont révélé des résultats assez différents.

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Mais avec le séquençage du génome du chien en 2005, les chercheurs ont commencé à étudier l'ADN nucléaire hérité des deux parents. Ce matériel, trouvé sur les autosomes, les chromosomes numérotés et non spécifiques au sexe trouvés dans le noyau d'une cellule, fournit l'outil le plus puissant encore pour comparer les populations et les individus au niveau génétique.

Un chien de village mongol. Les chiens sont assez divers.

Source: Doug Lally, utilisé avec permission.

Shannon rapporte qu'elle et ses collègues ont examiné les trois types d'ADN. Dans le processus, Shannon écrit qu'ils ont amassé "le plus grand panel de diversité canine assemblé à ce jour, permettant une comparaison efficace de Y, Mt [mitochondrial] et loci autosomiques pour évaluer les forces qui modèlent la variation génétique dans diverses populations canines. 185 805 marqueurs-allèles, ou variations du code génétique, qui s'accumulent dans les populations au fil du temps, résultat de la dérive génétique, des mutations, de la sélection naturelle et / ou artificielle, goulots d'étranglement, envahissement génétique par les populations extérieures et migration. Plus la variation d'un groupe ou d'une population dans son code génétique est grande, plus on pense qu'ils sont proches de la population fondatrice.

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Sans surprise, les chercheurs, la plupart associés au laboratoire du projet de diversité génétique des chiens villageois de l'Université Cornell d'Adam Boyko, professeur adjoint, ont découvert que les races modernes manquent de diversité car elles proviennent de pools génétiques limités et présentent des niveaux élevés de consanguinité; En effet, malgré leurs différences d'apparence parfois profondes, les chiens de race ne représentent qu'une fraction de la diversité génétique des chiens du monde, explique Shannon.

Ces races européennes génétiquement limitées ont voyagé avec leurs maîtres coloniaux et sont maintenant en demande parmi les classes moyennes et professionnelles urbaines en croissance dans de nombreux pays en voie de développement. Dans et autour de ces villes, les races européennes ont croisé abondamment avec des chiens de village indigènes et ont ainsi réduit leur diversité génétique et leur unicité, écrit Shannon.

Heureusement, cela ne semble pas être le cas loin des villes comme Le Caire et Beruit ou même Mumbai et Katmandou, ou dans les zones peu peuplées, non fréquentées par les Occidentaux et leurs chiens. Des chiens de village ne montrant pas de mélange significatif de gènes ont été trouvés dans suffisamment de parties différentes du monde pour que l'équipe de Boyko puisse effectuer leur analyse statistique complète de la diversité génétique, dont les résultats pointent vers l'Asie Centrale

L'explication parcimonieuse de ce qu'ils voient dans les données, écrit Shannon, est que les chiens sont apparus quelque part en Asie centrale et ont ensuite connu un goulot d'étranglement génétique sévère avant de déménager avec leurs humains vers d'autres régions avec le complément complet de la variabilité génétique. L'Asie de l'Est était la destination la plus immédiate, et là, les premiers chiens sont devenus plus nombreux et diversifiés.

L'interprétation alternative la plus plausible de leurs données, écrit Shannon, est que les chiens provenaient d'ailleurs et passaient par un goulot d'étranglement génétique moins sévère avant de se diversifier à nouveau en Asie centrale. Ils ont ensuite déménagé avec leur peuple alors que les glaciers commençaient à s'éloigner de leur avancée maximale. La population fondatrice de cet événement pourrait avoir disparu ou avoir été submergée génétiquement par des envahisseurs canins subséquents, dit-elle.

J'ai trouvé cette recherche intéressante, notamment parce qu'elle renforce et clarifie certaines des suggestions que j'ai avancées dans Comment le chien est devenu le chien sur le rôle crucial de l'Asie centrale dans l'histoire du chien. Je disais qu'en raison de leurs nombreuses affinités, les loups et les premiers humains modernes, comme on les appelle souvent, formaient une sorte d'union où et quand ils se rencontraient sur les traces des proies qu'ils chassaient, comme les rennes, les chevaux et les saïgas.

Certaines de ces alliances étaient plus fortes que d'autres et de là venaient des chiens-loups (chiens-loups) qui commençaient à voyager avec leurs humains errants, se mélangeant à divers points de rendez-vous qui grandissaient là où les sentiers migratoires se rencontraient. Les gens échangeaient des biens, des fourrures et des loups-garous qui se débrouillaient eux-mêmes avec de nouveaux groupes. De cette façon, ils se propagent rapidement, se mêlant aux loups locaux, au fur et à mesure. J'ai identifié un hub dans la région des mers Noire et Caspienne et des montagnes du Caucase, avec des routes migratoires majeures à travers la steppe à travers l'Asie centrale vers les montagnes de l'Altaï – pas une distance impossible. Là, des chiens et des gens se sont rassemblés et, au fur et à mesure que la glace fondait, se sont dispersés pour les Amériques, le Japon, la Corée, l'Asie de l'Est, l'Asie du Sud-Ouest, l'Europe et l'Afrique du Nord. Je soupçonne que la population canine comprenait à l'époque des chiens de grande taille, des chiens de petite taille et des chiens entre les chiens, ce qui constitue la fracture fondamentale.

Les preuves décrites ici pointent vers un événement de domestication, mais je me demande pourquoi il n'y en aurait pas eu plusieurs avec un mélange subséquent à ces points de rencontre. Nous pourrions commencer à avoir une vision plus claire dans un avenir pas si lointain.

En fait, tous ceux qui s'intéressent à ce sujet attendent maintenant que l'équipe internationale de chercheurs dirigée par Greger Larson à Oxford commence à rendre compte des résultats de leur analyse de l'ADN ancien des chiens et des loups du monde entier.