Des études dos à dos sur les probiotiques déclenchent des sonnettes d’alarme

Deux nouvelles études mettent en garde contre une approche unique des probiotiques.

Les probiotiques sont sur la sellette. Contrairement à la croyance populaire, il existe de plus en plus de preuves selon lesquelles les probiotiques pourraient ne pas être aussi efficaces universellement qu’on le pensait. En fait, de nouvelles recherches suggèrent que dans certains cas, la consommation de probiotiques commerciaux peut avoir des conséquences négatives.

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Voici un bref aperçu de la dernière recherche sur les probiotiques qui a sonné l’alarme pour les scientifiques du monde entier: Le 19 juin, une étude a été publiée reliant l’utilisation des probiotiques au brouillard cérébral et au ballonnement de ventre extrême chez certaines personnes. Une autre étude, publiée le 31 août, a révélé que la consommation de probiotiques après la prise d’antibiotiques était liée à des infections intestinales plus graves chez les souris exposées à Cryptosporidium . (Pour plus d’informations, voir «Dans un brouillard cérébral? Les probiotiques pourraient être le coupable» et «Des résultats inattendus incitent les scientifiques à repenser les probiotiques».)

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Plus récemment, deux articles consécutifs ont été publiés simultanément dans la revue Cell, le 6 septembre, montrant que de nombreuses personnes ne peuvent pas coloniser avec succès le microbiome probiotique standard dans leur intestin. Les scientifiques ont également découvert que la consommation de souches probiotiques génériques après la prise d’antibiotiques retardait souvent le retour des bactéries intestinales et l’expression des gènes à leur état «naïf» naturel.

La dernière étude en deux parties sur les probiotiques a été menée par des chercheurs du laboratoire Elinav d’Immunologie de l’Institut scientifique Weizmann en Israël et des collègues du centre médical de Tel Aviv. Eran Elinav a été l’auteur principal des deux études, aux côtés d’Eran Segal et de son laboratoire de biologistes informaticiens spécialisés dans la santé et les maladies liées au microbiome, à la nutrition, à la génétique et à la régulation des gènes.

«Les gens ont apporté beaucoup de soutien aux probiotiques, même si la littérature sous-jacente à notre compréhension de ceux-ci est très controversée. Nous voulions déterminer si les probiotiques tels que ceux que vous achetez au supermarché colonisent le tractus gastro-intestinal comme ils sont censés le faire, puis si ces probiotiques ont un impact sur l’hôte humain », a déclaré Eran Elinav dans un communiqué. «De manière surprenante, nous avons constaté que de nombreux volontaires en bonne santé étaient en réalité résistants en ce sens que les probiotiques ne pouvaient pas coloniser leur tractus gastro-intestinal. Cela suggère que les probiotiques ne devraient pas être universellement considérés comme un complément «one-size-fits-all». Au lieu de cela, ils pourraient être adaptés aux besoins de chaque individu. ”

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Dans la première étude Elinav, «La résistance personnalisée à la colonisation muqueuse intestinale des probiotiques empiriques est associée à des caractéristiques uniques de l’hôte et du microbiome», les chercheurs ont recruté 25 volontaires humains qui ont subi une endoscopie supérieure et une coloscopie afin d’obtenir une base de microbiome intestinal.

Ensuite, les participants à l’étude ont été divisés en un groupe ayant consommé une souche probiotique standard disponible dans les suppléments commerciaux et un groupe témoin recevant un placebo. Après deux mois de traitement, les chercheurs ont découvert que certaines personnes étaient des soi-disant «résistants» qui avaient expulsé les microbiomes intestinaux contenant des probiotiques. d’autres ont été identifiés comme «persistants» qui ont colonisé avec succès les souches probiotiques génériques dans leur tractus gastro-intestinal.

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Notamment, après que quelqu’un ait été marqué, un «persistant» ou un «résistant» a clairement révélé l’impact des probiotiques sur son microbiome autochtone et son profil de bactéries intestinales. “Bien que tous nos volontaires consommateurs de probiotiques aient montré des probiotiques dans leurs selles, seuls certains d’entre eux les ont montré dans leur intestin, ce qui est l’endroit où ils doivent être”, a déclaré Eran Segal dans un communiqué. «Si certaines personnes résistent et que seules certaines personnes le permettent, les avantages des probiotiques standard que nous prenons tous ne peuvent être aussi universels que nous le pensions. Ces résultats mettent en évidence le rôle du microbiome intestinal dans l’établissement de différences cliniques très spécifiques entre les personnes. ”

La seconde étude Elinav, intitulée «La reconstitution du microbiome du mucus muqueux post-antibiotique est altérée par les probiotiques et améliorée par la FMT autologue» a impliqué un modèle de souris et des patients humains. Une cohorte de souris et un groupe humain parallèle ont reçu la même souche probiotique que celle utilisée dans la première étude pour voir s’ils avaient plus de succès dans la reconstitution de leur microbiote intestinal après une série d’antibiotiques. Une autre cohorte de «vigilants» n’a pas pris de probiotiques pour aider à la récupération du microbiome intestinal après une déplétion liée aux antibiotiques. Une troisième cohorte a reçu une «greffe de microbiome fécal autologue» (aFMT) consistant en un microbiote intestinal du patient qui avait été collecté avant le début du cycle d’antibiotiques.

Ceux qui ont pris des probiotiques ont reconstitué le microbiome intestinal avec plus de succès que le groupe de surveillance et d’attente. Cela dit, il y avait aussi une réaction imprévue à l’utilisation de probiotiques. Les chercheurs ont été surpris de constater que la colonisation réussie du microbiome par des probiotiques empêchait le microbiome pré-antibiotique et le profil d’expression des gènes de l’intestin de revenir à son état naturel pendant des mois après le traitement. Mais il y a une bonne nouvelle: l’utilisation de l’aFMT a eu pour effet de ramener à la normale le microbiome intestinal et les profils d’expression génique du troisième groupe dans les jours suivant l’arrêt du traitement aux antibiotiques.

Cette étude présente quatre conclusions significatives: (1) la colonisation probiotique de la muqueuse intestinale murine n’est que légèrement augmentée par les antibiotiques, (2) la colonisation probiotique de la muqueuse intestinale humaine est significativement augmentée par les antibiotiques, (3) Après la prise d’antibiotiques, les probiotiques retardent le reconstitution du transcriptome chez la souris et l’homme, (4) La greffe de microbiome fécal autologue (FMT) rétablit la reconstitution du microbiome muqueux et du transcriptome intestinal.

«Contrairement au dogme actuel selon lequel les probiotiques sont inoffensifs et profitent à tout le monde, ces résultats révèlent un nouvel effet indésirable potentiel de l’utilisation de probiotiques avec des antibiotiques pouvant même avoir des conséquences à long terme», a déclaré Elinav dans un communiqué. “En revanche, reconstituer l’intestin avec ses propres microbes est un traitement personnalisé conçu par la mère et la nature et qui a entraîné une inversion complète des effets des antibiotiques.” Cela a ouvert la porte à des diagnostics qui nous mèneraient d’une analyse empirique. la consommation universelle de probiotiques, qui semble inutile dans de nombreux cas, est adaptée à l’individu et peut être prescrite à différents individus en fonction de leurs caractéristiques de base. ”

Références

Niv Zmora, Gili Zilberman-Schapira, Jotham Suez, Uria Mor, Mally Dori-Bachash, Stavros Bashiardes, Eran Kotler, Maya Zur, Dana Regev-Lehavi, Rotem Ben-Zeev Brik, Sara Federici, Yotam Cohen, Raquel Linevsky , Andreas E. Moor, Shani Ben-Moshe, Alon Harmelin, Shalev Itzkovitz, Nitsan Maharshak, Oren Shibolet, Hagit Shapiro, Meirav Pevsner-Fischer, Itai Sharon, Zamir Halpern, Eran Segal et Eran Elinav. «La résistance personnalisée à la colonisation de la muqueuse intestinale aux probiotiques empiriques est associée à des caractéristiques uniques de l’hôte et du microbiome.» Cellule (première publication: le 6 septembre 2018) DOI: 10.1016 / j.cell.2018.08.041

Jotham Suez, Niv Zmora, Gili Zilberman-Schapira, Uria Mor, Mally Dori-Bachash, Stavros Bashiardes, Maya Zur, Dana Regev-Lehavi, Rotem Ben-Zeev Brik, Sara Federici, Max Horn, Yotam Cohen, Andreas E. Moor, David Zeevi, Tal Korem, Eran Kotler, Alon Harmelin, Shalev Itzkovitz, Nitsan Maharshak, Oren Shibolet, Meirav Pevsner-Fischer, Hagit Shapiro, Itai Sharon, Zamir Halpern, Eran Segal, Eran Elinav. «La reconstitution du microbiome du mucus intestinal post-antibiotique est altérée par les probiotiques et améliorée par la FMT autologue.» Cellule (Première publication: le 6 septembre 2018) DOI: 10.1016 / j.cell.2018.08.047