Des résultats inattendus incitent les scientifiques à repenser les probiotiques

La consommation de probiotiques commerciaux peut avoir des conséquences négatives dans certains cas.

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Au cours des derniers mois, des preuves surprenantes ont émergé selon lesquelles des probiotiques disponibles dans le commerce contenant «de bonnes bactéries pour le microbiome intestinal» pourraient ne pas être la panacée que la plupart d’entre nous ont fini par croire.

Une étude de juin 2018, intitulée «Brumatisme cérébral, gaz et ballonnements: un lien entre le SIBO, les probiotiques et l’acidose métabolique», a révélé que chez certaines personnes (pour des raisons encore mal comprises), l’utilisation de probiotiques entraînait une prévalence plus élevée de sur-croissance »(SIBO) et« acidose D-lactique », corrélée au gonflement extrême du ventre et à la formation de voile dans le cerveau. (Pour plus d’informations, voir “Dans un brouillard cérébral? Les probiotiques pourraient être le coupable.”)

Le 31 août, une nouvelle étude sur les animaux publiée en ligne indique que les souris ayant consommé un probiotique commercial destiné à la consommation humaine ont été exposées à des infections plus graves liées au parasite intestinal Cryptosporidium parvum . Cet article, «Un produit probiotique augmente la susceptibilité des souris à la cryptosporidiose», a été publié dans la revue Applied and Environmental Microbiology .

Selon une méta-analyse financée par la Fondation Bill & Melinda Gates et publiée dans The Lancet: Global Health, la cryptosporidiose a été associée à environ 48 000 décès dans le monde en 2016 et a entraîné la perte de plus de 4,2 millions d’années de vie ajustées sur l’incapacité. Actuellement, il n’existe aucun médicament ou vaccin spécifique permettant de traiter ou de prévenir efficacement la cryptosporidiose. Les auteurs de cette analyse concluent que «les interventions conçues pour prévenir et traiter efficacement les infections chez les enfants de moins de cinq ans auront d’énormes impacts sur la santé publique et le développement social».

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Micrographie montrant la cryptosporidiose. Les cryptosporidium sont les petits corps ronds dans les vacuoles apicales à la surface de l’épithélium.

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La dernière étude sur les répercussions potentielles de l’utilisation de probiotiques est particulièrement intéressante, c’est que lorsque Bruno Oliveira et Giovanni Widmer de l’Université Tufts ont conçu leur étude, ils s’attendaient à ce que l’influence des probiotiques et des «bonnes bactéries» sur la microflore produise des intestins de souris. plus résilient à l’infection. Mais le résultat inverse s’est produit. En moyenne, Oliveira et Widmer ont découvert de manière inattendue que des souris exposées à Cryptosporidium et à qui on avait administré des probiotiques avaient développé des infections intestinales plus graves . D’un autre côté, un groupe témoin de souris exposées au même parasite intestinal et ne consommant pas de probiotiques a présenté des infections moins graves .

Pour cette expérience, le microbiote intestinal natif de souris a été appauvri par administration orale d’un antibiotique. Les humains et les souris sont tous deux plus vulnérables aux infections intestinales après une série d’antibiotiques. Tout comme les médecins recommandent souvent aux probiotiques de réinitialiser les «bonnes bactéries» de l’intestin après la prise d’antibiotiques, les souris ayant reçu des antibiotiques recevaient un probiotique conçu pour la consommation humaine, dilué dans leur eau de boisson.

Malgré un résultat qui contredit leur hypothèse de recherche initiale, les résultats de cette étude fournissent une preuve inédite qu’il est possible de développer des probiotiques plus précis qui pourraient atténuer la cryptosporidiose. Avant cette recherche, on ne savait pas si les probiotiques présents dans le régime alimentaire pourraient influer sur la croissance de Cryptosporidium dans l’intestin.

«L’objectif est maintenant de trouver un lien mécanique entre la microflore et la prolifération de Cryptosporidium et, au final, de concevoir un simple supplément nutritionnel qui aide l’organisme à combattre l’infection», a déclaré l’auteur principal Giovanni Widmer, professeur en maladies infectieuses et en santé mondiale chez Cummings. École de médecine vétérinaire de l’Université de Tufts, a déclaré dans un communiqué. “L’identification de mécanismes spécifiques modifiant la virulence de l’agent pathogène en réponse à un régime alimentaire peut permettre le développement de pré- ou probiotiques simples capables de modifier la composition du microbiote afin de réduire la gravité de la cryptosporidiose.”

Oliveira et Widmer résument l’importance de leurs conclusions. «Les résultats montrent que Cryptosporidium parvum répond aux changements du microenvironnement intestinal induits par un complément nutritionnel. Ce résultat ouvre la voie aux recherches visant à identifier des interventions nutritionnelles visant à limiter l’impact de la cryptosporidiose. ”

Au-delà des probiotiques: le génie génétique pourrait conduire à un microbiome synthétique

Il existe plus d’un millier de souches de bactéries différentes dans l’intestin humain. Les scientifiques commencent seulement à comprendre comment différentes colonies de microbiomes intestinaux communiquent entre elles. Cela dit, un consortium de Harvard regroupant des scientifiques du Wyss Institute de l’Université de Harvard, de la faculté de médecine de Harvard et du Brigham and Women’s Hospital s’emploie à créer un «microbiome synthétique».

Dans un modèle murin, ce système de transmission de signaux génétiques a montré la capacité d’envoyer et de recevoir des signaux sur la densité globale de la colonie bactérienne de l’intestin et de réguler l’expression de gènes spécifiques au sein de colonies de microbiomes. Ces résultats potentiellement novateurs ont été publiés le 20 août dans un article intitulé «Quorum Sensing peut être réutilisé pour promouvoir le transfert d’informations entre bactéries dans l’intestin des mammifères».

Les auteurs résument l’essentiel de cette recherche dans le résumé de l’étude: «Le microbiome intestinal est impliqué de manière complexe dans l’établissement et le maintien de la santé de l’hôte. L’ingénierie des microbes intestinaux vise à ajouter de nouvelles fonctions et à élargir le champ de contrôle du microbiome intestinal. Pour créer des systèmes capables d’exécuter des tâches de plus en plus complexes dans l’intestin, il est nécessaire d’exploiter la capacité de la bactérie à communiquer dans l’environnement intestinal. Cette étude fournit une base pour mieux comprendre les interactions inter-bactériennes dans un environnement autrement difficile à étudier. ”

«En fin de compte, nous visons à créer un microbiome synthétique comprenant des espèces de bactéries totalement ou principalement génétiquement modifiées dans l’intestin, chacune ayant une fonction spécialisée (par exemple, détecter et guérir une maladie, créer des molécules utiles, améliorer la digestion, etc.), mais également communiquer avec les autres pour veiller à ce qu’ils soient tous équilibrés pour une santé humaine optimale », a déclaré l’auteur correspondante Pamela Silver dans un communiqué. Silver est un membre fondateur du département de biologie des systèmes de la faculté de médecine de Harvard et un chercheur principal du Silver Lab.

En conclusion, Donald Ingber, directeur fondateur du Wyss Institute for Engineering Engineering inspiré par la biologie à l’université Harvard, a mis en contexte le travail de son équipe et l’importance primordiale de la recherche avancée sur les bactéries intestinales: «Le microbiome est la prochaine frontière en médecine et en bien-être. . Concevoir de nouvelles technologies pour améliorer les microbes intestinaux tout en reconnaissant qu’ils font partie d’une communauté complexe, comme c’est le cas ici, représente une avancée majeure dans cette direction. »

Références

Bruno CM Oliveira et Giovanni Widmer. «Un produit probiotique augmente la susceptibilité des souris à la cryptosporidiose.» Microbiologie appliquée et environnementale (Première publication en ligne: le 31 août 2018) DOI: 10.1128 / AEM.01408-18

Suhyun Kim, Jordan Kerns, Marika Ziesack, Lynn Bry, Georg K. Gerber, Jeffrey C. Way, Pamela A. Silver. «Quorum Sensing peut être réutilisé pour promouvoir le transfert d’informations entre bactéries dans l’intestin des mammifères.» ACS Synthetic Biology (Première publication en ligne: le 20 août 2018) DOI: 10.1021 / acssynbio.8b00271

Satish SC Rao, Abdul Rehman, Siegfried Yu, Nicole Martinez de Andino. «Brouillard cérébral, gaz et ballonnements: un lien entre SIBO, probiotiques et acidose métabolique». Gastroentérologie clinique et translationnelle (première publication: le 19 juin 2018) DOI: 10.1038 / s41424-018-0030-7